Le plugin Doxygen permet depuis Eclipse de générer automatiquement la documentation.

Pour l'installer, dans eclipse : allez dans Help>Software updates>Find and install...et choisissez [Search for new features] puis [Next]. Sur la seconde page cliquez sur [New remote site...]. Choisissez un nom, « Doxygen » par exemple, et entrez l'URL suivante : http://download.gna.org/eclox/update/. Ensuite cochez le nom que vous avez choisi puis cliquez sur [Finish].

Pour générer une documentation, cliquez sur l'icône avec un point d'interrogation jaune. Puis choisissez le fichier de configuration.